「ショタコン」と「ショコタン」と「シャコタン」は、発音が似ていて、表記も酷似しているため、紛らわしいですね。ネタかどうか分かりませんが、知恵袋やokwave系のサイトでも、この質問は時折あげられているようです。

　まず、ショタコンは、男児に対するロリコンと同様で、男性による男児に対する異常性欲の持ち主（つまり男色）を指します。こういった趣味は、通常人には理解しがたいですが、いろいろな人がいるものですね。名前がついていることからすると、それほど珍しいことではないのかもしれません。

　ショコタンは、マルチタレントである中川翔子のニックネームであり、それ以上でもそれ以下でもありません。「翔子たん」から来ているというのは容易に想像がつきますね。

　シャコタンとは、車高を低く改造した自動車の俗称で、不良や暴走族のトレードマークでもあります。車高が短い、という意味でしょうか？

　よって、使われる文脈も意味もまるで異なるこの３つのワードですが、 似ているというのは興味深いですね。間違えて使うと恥をかくことになりそうなので、注意が必要です。